甘薯收获后，贮藏不当，会引起烂窖。烂窖的原因有以下几个方面：
一、冷害有的品种在10℃以下时，薯块的细胞原生质活动停滞，影响生机。在？？2℃时，薯块的细胞间隙结冰，组织破坏，发生冻害。薯块受冷害或冻害表现的特征是：改变了细胞膜的透性，细胞内钾、钙、镁等离子大量漏失，致使氧化酶的作用削弱，影响薯块的新陈代谢，抗病性与耐贮藏性降低；薯块吸水力减弱，绿原酸增多，薯块切口与氧气接触后，变为褐色，味道变苦，用手挤压薯块发软，切口流出清水，缺少白浆，煮熟时出现硬心。薯块受冷害的温度越低，发生腐烂越快。例如，在4~5℃下，约半个月开始腐烂；在6~7℃下，约一个月发生腐烂。甘薯多在12月下旬和翌年1月的低温期受冷害，到2月发生腐烂。薯块腐烂时由于发热而常被误认为是热害。
二、病害薯块在窖内发病的原因是薯块带病、破皮受伤或窖内病菌感染。黑斑病发生于贮藏初期温度较高的时期，软腐病多发生于在受冷害后的贮藏后期。
三、湿害或干害甘薯如窖后10多天，因气温较高，出现呼吸高峰，薯堆温度升高，薯堆内水汽上升到堆表时，因温度较低凝结为水，俗称“发汗”，会引起堆表薯块造成湿害。盖草可防止“发汗”，对贮藏有利。当窖内温度过低时，薯块原生质失水过多，酶的活动失常，增加有机物的分解，发生皱皮“糠心”，组织容易腐烂。窖内以保持85%~90%的相对湿度为宜
四、缺氧甘薯贮藏初期气温较高，呼吸强度大，如果封窖过早，致使窖内氧气减少，二氧化碳增多，造成缺氧呼吸，薯块发生硬心，生机减弱，甚至发生腐烂。
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